正相色譜柱在存儲時一般使用有機溶劑進行保護。常用的有機溶劑包括乙腈（acetonitrile）和甲醇（methanol）。這些溶劑具有較低的蒸汽壓和良好的保存性能，可以防止柱子干燥和封端材料老化。使用這些溶劑來保存柱子有助于延長柱子的壽命。

一般的保存方法是，取下柱子兩端的聯接管，用分離扇或者注射器注入一定量的有機溶劑，然后用帽子或保護蓋封好柱子兩端，防止溶劑的揮發。在存儲柱子時，需要將柱子置于室溫下，遠離日光直射和潮濕環境。

需要注意的是，每個柱子可能對不同溶劑的耐受性有所差異，請事先查看柱子的使用說明書或與柱子供應商咨詢，以確定最適合保存柱子的溶劑。